Các tác dụng phụ do sử dụng kháng sinh là phổ biến và thường gặp nhất là các ảnh hưởng đến hệ tiêu hóa, có thể bao gồm tiêu chảy, buồn nôn, nôn, đầy hơi và đau bụng. Những biểu hiện này xuất hiện khi thuốc kháng sinh làm xáo trộn sự cân bằng giữa các vi khuẩn có lợi và vi khuẩn có hại, làm cho các vi khuẩn gây bệnh phát triển nhanh chóng theo cấp số nhân và vượt quá mức bình thường.

Có tới 40% trẻ em dùng các kháng sinh phổ rộng sẽ bị tiêu chảy. Trong đó, một tỉ lệ lớn các tác dụng phụ có thể khiến việc điều trị bị gián đoạn kèm theo nguy cơ thất bại điều trị và gia tăng sự đề kháng kháng sinh.

Probiotics được xem là có hiệu quả trong việc kiểm soát sự phát triển quá mức của các vi khuẩn có hại và có thể giúp ngăn ngừa hoặc làm giảm tỉ lệ các tác dụng phụ do kháng sinh. Bệnh nhân thường không muốn trị liệu kháng sinh nếu họ đã từng gặp những tác dụng phụ trước đây. Một lựa chọn để tránh vấn đề này là sử dụng Probiotic.

L.reuteri Protectis đã được nghiên cứu ở trẻ em như một liệu pháp hỗ trợ điều trị kháng sinh, và được chứng minh là làm giảm đáng kể các tác dụng phụ do kháng sinh.

Dưới đây là các biểu đồ sau nghiên cứu của L.reuteri Protectis (BioGaia), biểu đồ chứng minh BioGaia giảm các rối loạn về đường tiêu hóa lên đến 75%.